北京海淀區食品經營許可證的辦理流程如下：

1. 準備申請材料：需要準備《食品流通許可申請書》、營業執照、法人身份證復印件、食品安全管理人員身份證復印件、食品安全管理制度、食品經營場所使用證明等材料。

2. 提交申請：將準備好的材料提交給當地市場監督管理局。

3. 現場核查：市場監督管理局會派員對申請人的經營場所進行現場核查，檢查是否符合相關法律法規的要求。

4. 審核批準：市場監督管理局對申請人提交的材料和現場核查情況進行審核，決定是否批準頒發食品經營許可證。

5. 領取證件：如果審核通過，申請人可以到當地市場監督管理局領取食品經營許可證。

需要注意的是，不同地區和不同類型的食品經營許可證所需要的材料和流程可能會略有不同，建議在申請前先咨詢當地市場監督管理局或者律師。