食品經營許可證和衛生許可證都是與食品衛生安全相關的證件，它們在以下六個方面存在明顯的區別：

1. 定義：衛生許可證是單位和個人從事食品生產及餐飲店的經營活動，經衛生行政部門審查批準后，發給的衛生許可憑證，有注冊備案的許可證號。而食品經營許可證是指在中華人民共和國境內，取得營業執照等，從事食品銷售和餐飲服務活動的合法主體，經食品藥品監督管理部門審查批準后發給的食品經營許可憑證。

2. 發放部門：衛生許可證由衛生行政部門發放，而食品經營許可證由食品藥品監督管理部門發放。

3. 應用范圍：衛生許可證主要針對一些衛生需要達到標準的行業或公共場所。食品經營許可證主要針對食品銷售流通環節、餐飲服務領域。

4. 辦理流程：衛生許可證和食品經營許可證的辦理流程包括準備材料、填寫申請表、遞交申請、審核材料、現場檢查、審批和領取證件等步驟，但具體流程和要求可能因地區而異。

5. 有效期：衛生許可證和食品經營許可證都有一定的有效期，需要在到期前進行續期或重新申請。

6. 法律責任：持有衛生許可證或食品經營許可證的企業在經營過程中需要遵守相關的法律法規，否則可能會面臨法律責任。

總結來說，雖然兩者都與食品安全相關，但具體的應用范圍、辦理流程和要求有所不同。因此，在實際運營中，企業需要根據自身的業務類型和需求，了解并遵守相關的法律法規，確保合法經營。

以上信息僅供參考，具體流程和要求可以咨詢當地食品藥品監督管理部門或衛生行政部門。