海淀區食品經營許可證和衛生許可證的代辦流程及材料如下：

一、辦理流程

1. 準備相關材料，并前往海淀區食品藥品監督管理局進行咨詢和預約。

2. 在預約時間內攜帶材料前往該局提交申請，并繳納相關費用。

3. 該局將對申請材料進行審核，審核通過后進行現場檢查。

4. 現場檢查通過后，該局將頒發食品經營許可證。

二、辦理材料

1. 食品經營許可證申請書。

2. 企業名稱預先核準通知書復印件。

3. 衛生管理組織（架構）名單。

4. 各類場所衛生管理制度。

5. 主要生產設備清單。

6. 食品安全管理師任命書及身份證復印件。

7. 從業人員健康證。

8. 培訓證明。

三、疑難問題解決

在辦理食品經營許可證過程中，可能會遇到以下疑難問題：

1. 對相關法規和規定不夠了解，導致申請材料不齊全或不符合要求。

2. 現場檢查時發現衛生條件不符合要求，需要整改。

3. 從業人員健康證過期或缺失。

針對這些問題，可以采取以下措施進行解決：

1. 在提交申請前，認真閱讀相關法規和規定，確保申請材料齊全、符合要求。

2. 在現場檢查前，對經營場所和設備進行全面檢查和清潔，確保衛生條件符合要求。

3. 及時安排從業人員進行健康檢查，確保其健康證有效。

請注意，具體流程和所需材料可能會因地區和具體情況有所不同。因此，建議在辦理前詳細咨詢當地相關部門或服務機構，以確保流程順利和材料齊全。